si en tu última relación sexual usaron bien el preservativo, es decir comprobaron que no se rompió y que todo el semen se quedó dentro del condón, debes quedarte tranquila porque ese retraso no es por embarazo. Un retaso menstrual se puede deber a muchos motivos desde problemas de quistes o hasta la misma preocupación o tensión de no tener la seguridad de que no estás embarazada.
Yo te recomendaría que te hagas una prueba de embarazo si ya pasaron por lo menos 3 semanas desde esa última relación sexual.