El tiempo indicado para hacerse una prueba de embarazo y que el resultado sea confiable, es a partir de la tercera semana posterior al encuentro sexual. Ahora si comentas que te hiciste una ecografía transvaginal, supongo que fue por recomendación del ginecólogo, pero hasta donde tengo entendido, cuando se desea saber si estás o no embarazada se practica una ecografía pélvica para poder visualizar el embrión.
Si las últimas pruebas te dieron negativo, creo que no estás embarazada.