puedes limpiar bien el pepino antes, y si lo desinfectas bien... no tiene por qué causarte ningún daño, salvo que seas alérgica (o alérgico) a la piel del pepino
mi recomendación es que para empezar, limpies bien el pepino por fuera (con agua y jabón) y te lo frotes por tu antebrazo y que veas si ocurre alguna reacción en tu cuerpo
suerte