lo ideal es aplicarse cualquier método anticonceptivo el primer día de regla, cuando se trata de la primera vez, luego de eso las veces posteriores te la tendrás que aplicar en la fecha indicada para el cambio. Si en tu caso te la aplicaste 12 días después de la fecha, no sé si el método siga teniendo el mismo efecto en tu organismo.
Lo mejor que puedes hacer es ir al ginecólogo y hacerle la consulta directamente a él, ya que él luego de evaluarte te dirá si sigues o no estando protegida por la inyección. Además de eso, no te olvides que si vas a tener relaciones sexuales lo mejor hasta no tener la certeza de que estás protegida, es que tu pareja utilice preservativo para evitar un embarazo no deseado.