Si tuviste relaciones dentro del periodo de la inyección, no hay riesgo de embarazo. Si hubieras tenido relaciones fuera del tiempo de protección de la inyección tal vez podría haber alguna posibilidad, pero por lo que comentas no es tu caso asi que quédate tranquila.
Ese retraso puede deberse a un problema hormonal, de todas formas sería bueno que vayas al médico y te hagas un chequeo para salir de dudas.