creo que luego de tomar la pastilla de emergencia ya no debes seguir tomando la pastilla anticonceptiva. Te explico, la función de la pastilla anticonceptiva es hacer que tu cuerpo no ovule para no los óvulos ante una posible eyaculación no sean fecundos, pero la pastilla de emergencia lo que hace es cargarte de hormonas con el fin de obligar al cuerpo a que menstrue para evitar una fecundación de algún óvulo. Entonces en tu caso ya interrumpiste ese ciclo de las pastillas porque tu cuerpo ya regló y no tiene sentido que las sigas tomando.
No sé si tu ginecólogo te lo explicó pero las pastillas anticonceptivas luego del primer mes son seguras y si tienes relaciones sin preservativo no hay riesgo porque tu cuerpo ya se adaptó al efecto anovolutorio de las pastillas, por lo cual ya no era necesario que tomes la pastilla de emergencia. Si ustedes deciden usar los dos métodos esta bien, pero si en alguna sólo tú te cuidas no habrá riesgo.