si hubo algún riesgo de embarazo al tener relaciones sin haberte aplicado la inyección en su periodo adecuado, pero si ya te has hecho una prueba de embarazo y ha salido negativo eso indica que por lo menos no estas embarazada. Ahora el motivo de que tu periodo no llegue puede deberse al cambio de fecha en la aplicación del método. Espera tranquila porque con la prueba ya sabes que no estas embarazada. Saludos