Si hay riesgo de embarazo asi que si aún estas a tiempo de tomar la pastilla del día siguiente te recomiendo que lo hagas, no te confíes por haber estado en tu segundo día de regla eso no garantiza nada.
La menstuación se suspendio porque a lo mejor el cuerpo sintió el cambio al estar preparado para la menstruación y no para la penetración de la vagina.